Dans Aqua, votre point de départ est un point chaud qui est progressivement entouré de formations coralliennes en expansion. Ces coraux servent d’habitats aux petits animaux marins. En favorisant la biodiversité des habitats, vous pouvez ensuite créer les conditions idéales pour attirer les plus gros animaux marins.

À votre tour, vous devez prendre une nouvelle tuile de corail sur le marché et l’ajouter à votre récif, puis vous pouvez aussi attirer des animaux dans votre écosystème si vous créez les bons modèles de coraux. À la fin de la partie, le joueur qui a créé les meilleures formations coralliennes et qui a attiré le plus grand nombre de petits et de grands animaux marins marquera le plus de points et gagnera.